Molekylär artbestämning
Utvecklingen av molekylära metoder går oerhört snabbt och tack vare forskarna på Station Linné så är nu några av dessa moderna metoder allmänt tillgängliga och utgör en språngbräda för snabb och verifierad artbestämning av såväl svårbestämda arter som för stora fällprover med tusentals, ibland tiotusentals, insekter.

Station Linnés PCR-rum

INSEKTER

För störrer ordrar, från 5 metabarkodade prover och uppåt, så är kostnaden 2 500 kr per prov och 15 000 kr för bioinformatiken (dvs artlistor för samtliga prover hur många de än är).
På varje order tillkommer en administrationskostnad på 495 kronor.
För privatpersoner tillämpas förskottsbetalning.

FÅGEL

Vid resultatlös analys tas en administrationskostnad på 495 kronor ut.
För privatpersoner tillämpas förskottsbetalning.

ALLMÄNT

Väldigt förenklat kan man säga att vi på Station Linné använder oss av två olika DNA-metoder för artbestämning av insekter: individstreckkodning och metastreckkodning. Gemensamt för de båda metoderna är insekterna finns kvar i insamlat skick efter analys. Vid individstreckkodning sekvenseras så som termen säger DNA från djuren var för sig, medan det i metastreckkodning sekvenseras DNA från massor av exemplar samtidigt (ofta upp till tiotusentals, men det finns egentligen ingen övre gräns). Såväl ägg, larver och puppor som färdigbildade insekter kan analyseras. För att maximera förutsättningarna att lyckas med DNA-streckkodningen ska materialet helst samlas in och förvaras på ett korrekt sätt. Ju kallare och mörkare, desto bättre. Äldre material kan fungera, men nyare är att föredra. Om djuren förvaras torrt eller i etanol spelar ingen större roll men långvarig exponering av etylacetat skadar insektens DNA. Materialet kan lämnas direkt på Station Linné eller skickas med post, men kontakta först labbet angående uppdraget. 

Att extrahera DNA ur till exempel fågelfjädrar är en betydligt mer krävande process i vilken mycket längre DNA-sekvenser extraheras fram och helt andra kemikalier och maskiner används. Även här gäller förstås att ju fräschare materialet är som vi får oss tillsänt, ju större är chansen för en lyckad extraktion. Idealiskt är om man kan rycka några fjädrar från exempelvis en nätfångad fågel, eller om man ser en fågel som tappar en (men helst flera) fjädrar som man kan samla ihop och skickar för analys så snart som möjligt. Insamlade fjädrar som inte kan skickas till forskningsstationen på en gång bör förvaras kallt, helst i frys.

Metabarkodning in progress

Bra att veta

• Metoderna fungerar på ägg, larver, puppor och vuxna individer.

• DNA bevaras bäst mörkt och kallt. Nyinsamlat material är att föredra.

• Torr eller i etanol är bra. Undvik lång exponering i etylacetat.

• Förutom insekter har vi även analyserat mångfotingar och spindeldjur. Även andra djurgrupper kan bli aktuella.

• Vi laddar upp sekvenser och fynd i publika databaser.

• Materialet kan lämnas direkt på Station Linné eller skickas med post, men kontakta först labbet angående uppdraget: lab@stationlinne.se