Molekylär artbestämning
Utvecklingen av molekylära metoder går oerhört snabbt och tack vare forskarna på Station Linné så är nu några av dessa moderna metoder allmänt tillgängliga och utgör en språngbräda för snabb och verifierad artbestämning av såväl svårbestämda arter som för stora fällprover med tusentals, ibland tiotusentals, insekter. För närvarande ligger vårt fokus på insekterna, men inom kort kommer vi kunna erbjuda liknande tjänster också för andra organismgrupper så som till exempel fåglar och växter.
Artikel |
Kostnad |
Individstreckkodning, insekter |
47 Kr per exemplar
|
Metabarkodning, rådata insektsprover |
2 500 Kr per prov |
Metabarkodning, artlista insektsprover |
6 000 Kr per prov |
På varje order tillkommer en administrationskostnad på 495 kronor
Väldigt förenklat kan man säga att vi på Station Linné använder oss av två olika DNA-metoder för artbestämning av insekter: individstreckkodning och metastreckkodning. Gemensamt för de båda metoderna är insekterna finns kvar i insamlat skick efter analys. Vid individstreckkodning sekvenseras så som termen säger DNA från djuren var för sig, medan det i metastreckkodning sekvenseras DNA från massor av exemplar samtidigt (ofta upp till tiotusentals, men det finns egentligen ingen övre gräns). Såväl ägg, larver och puppor som färdigbildade insekter kan analyseras. För att maximera förutsättningarna att lyckas med DNA-streckkodningen ska materialet helst samlas in och förvaras på ett korrekt sätt. Ju kallare och mörkare, desto bättre. Äldre material kan fungera, men nyare är att föredra. Om djuren förvaras torrt eller i etanol spelar ingen större roll men långvarig exponering av etylacetat skadar insektens DNA. Materialet kan lämnas direkt på Station Linné eller skickas med post, men kontakta först labbet angående uppdraget.
Bra att veta
• Metoderna fungerar på ägg, larver, puppor och vuxna individer.
• DNA bevaras bäst mörkt och kallt. Nyinsamlat material är att föredra.
• Torr eller i etanol är bra. Undvik lång exponering i etylacetat.
• Förutom insekter har vi även analyserat mångfotingar och spindeldjur. Även andra djurgrupper kan bli aktuella.
• Vi laddar upp sekvenser och fynd i publika databaser.
• Materialet kan lämnas direkt på Station Linné eller skickas med post, men kontakta först labbet angående uppdraget: lab@stationlinne.se