Station Linnés miljöövervakning
Det råder idag i det närmaste konsensus om att vi måste försöka bevara så mycket som möjligt av en alltmer hotad och utsatt biologisk mångfald. Men ett minimikrav för att kunna göra det är ju att vi vet vilka arterna är som utgör mångfalden, var de finns, när de uppträder och vilka livsbetingelser som respektive art kräver. Först då kan vi värna om mångfalden på riktigt! Fast på samma gång som kunskapen om naturen och miljön känns extra viktig så når oss en strid ström av dystopiska rapporter om klimatförändringar, kraschade insektspopulationer, massutdo¨enden och invasiva arter, så det är bråttom! Samtidigt utvecklas nya, molekylära metoder för såväl snabb som verifierad artbestämning. Utvecklingen på området går oerhört snabbt och tack vare forskarna på Station Linné på Öland så är nu några av dessa moderna metoder allmänt tillgängliga för alla

Den största andelen av den biologiska mångfalden och biomassan landlevande djur utgörs av insekter. Som bland annat predatorer, nedbrytare och pollinatörer är de en förutsättning för alla terrestra ekosystem. Fluktuationer i insekternas artsammansättning och populationsstorlekar är viktiga indikationer på underliggande miljöförändringar. Insekternas korta generationstid och stora förökningspotential gör att de snabbt svarar på förändringar vilket gör dem särskilt lämpliga i miljöövervakning och förebyggande naturvårdsarbeten. Men trots insekternas betydelse så är övervakning av dem anmärkningsvärt eftersatt. Av alla Sveriges tiotusentals insektsarter så omfattas idag bara ett hundratal av övervakningsprogram (dagfjärilar, bin och blomflugor, samt enstaka hotade arter och skadeinsekter) - Övervakning av mindre än en procent av landets insektsarter kan inte ge en rättvis bild av förhållandena i de olika ekosystemen. Men att artbestämma alla insekter har hittills varit en orealistisk uppgift. Så är inte längre fallet. De senaste årens framsteg inom molekylärbiologisk artbestämning har drastiskt sänkt både kostnaden och hanteringstiden och därmed gjort en mer omfattande insektsövervakning möjlig.

Station Linné utför miljöövervakning av insekter med moderna DNA-baserade metoder
På Station Linné har vi 20 års erfarenhet av att sortera och artbestämma insekter. I våra moderna DNA-labb har vi dessutom möjligheten att artbestämma insekter med DNA-streckkodning (en metod som använder en mindre del av en organisms arvsmassa för att skilja ut arter från varandra). I miljöövervakning använder vi främst två olika metoder för DNA-baserad artbestämning: Hybridmetoden och Metastreckkodning.

Metastreckkodning

Här analyseras allt DNA samtidigt från alla insekter i till exempel ett och samma malaisefälleprov. Metoden lämpar sig väl för länsstyrelser, kommuner eller intresseorganisationer som snabbt vill få reda på vilka insekter som finns i ett område, men kan såklart vara högintressant också för dig som vill ta reda på vilka arter som flyger omkring i din trädgård eller annan intressant plats. En mild lysering extraherar DNA från cellerna samtidigt som insekterna bevaras intakta. DNA-streckkoder sekvenseras på en Illumina-plattform som kan processa flera prover med tusentals arter samtidigt. Därefter sorteras sekvenserna i kluster (motsvarande arter) i oöverträffade artlistor. Metastreckkoding blir därmed väldigt kostnadseffektivt när det rör sig om till exempel stora malaisefälleprover med tusentals insamlade insekter. Metoden, som med fördel kan användas vid miljöövervakning eller lokala inventeringar av hela insektsbiom, har dock sina begränsningar. Antalet individer måste uppskattas utifrån det relativa antalet sekvenser, och den stora mängden insekter gör det svårt, för att inte säga omöjligt, att veta om det är någon art som missats. Det är dessutom en svår uppgift att leta upp ett visst djur från ett analyserat prov med tusentals insekter om anledning finns för det. Men helt klart är att metoden genererar oslagbara artlistor och inte sällan kan tusentals insektsarter konstateras från en enda plats – begär offert på lab@stationlinne.se.

 

Hybridmetoden
Denna metod kombinerar klassisk insektssortering med DNA-baserad artbestämning. Station Linnés taxonomiska experter identifierar de olika arterna baserat på deras utseende samtidigt som deras individantal (abundans) uppskattas. Representanter från varje art väljs ut och deras DNA-streckkoder sekvenseras på MinION plattformen, med kapaciteten att sekvensera 10 000 individuella insekter på samma gång. Resultatet är artlistor och abundanser för de olika arterna samt referensexemplar som kan användas för att beskriva eventuella nya arter.

Vår hemsida använder sig av cookies. Genom att fortsätta surfa på sidan godkänner du att vi använder cookies. Klicka här för mer information.

Jag förstår